A segurança é uma das principais características do serviço Office 365 da Microsoft. Vai desde o hardware e software, à segurança física dos datacenters, às políticas de segurança e controlo e à verificação por auditores independentes. Além de todas as medidas que a Microsoft toma para garantir a proteção da informação, também possibilita aos seus clientes funcionalidades para ir de encontro às necessidades de segurança das diferentes organizações.